Scooby-Doo et tous ses amis embarquent à bord d'un bateau pour une croisière dans le Triangle des Bermudes. Rapidement, l'expédition prend une tournure catastrophique. En effet, la bande de Scooby-Doo se retrouve confrontée à toutes sortes de créatures terrifiantes. Scooby-Doo doit faire preuve d'un courage à toute épreuve pour affronter spectres, extraterrestres et pirates fantômes. Ces derniers sont sans conteste les plus redoutables, puisqu'ils coulent les navires croisant dans les eaux du Triangle des Bermudes à coup de boulets de canons...